一个色导航 FlowJo v10.8.1 流式细胞分析软件
发布日期:2024-10-24 04:51 点击次数:102
FlowJoTM 10是一款广宽好用的流式细胞数据分析软件,通过图像分析细胞的多样变化一个色导航,愚弄软件自带的分析功能,结合细胞模子创建合理的数据分析平台。
流式细胞时候(flow cytometry,FCM)是愚弄流式细胞仪进行的一种单细胞定量分析和分选时候。流式细胞术是单克隆抗体及免疫细胞化学时候、激光和电子计较机科学等高度发展及详细愚弄的高时候产物。流式细胞术责任旨趣是在细胞分子水平上通过单克隆抗体对单个细胞或其他生物粒子进行多参数、快速的定量分析。它不错高速分析上万个细胞,并能同期从一个细胞中测得多个参数,具有速率快、精度高、准确性好的优点,是现代伊始进的细胞定量分析时候之一。
软件功能路线式设门
FlowJoTM特有的路线式设门试一次立异性的创新。他一改传统复杂的逻辑门设立,将细胞群之间的逻辑关系用圣洁的递进路线式去呈现,并不错自界说细胞群称号、进而直不雅的执行细胞群统计值,让分析扫尾一目了然,圣洁明晰。
图像呈现法
多维参数败露
FlowJoTM提供了纯真实数据呈现方式,全标的满足用户的数据分析需要。它不错呈现一维的直方图,传统的二维图形,及动态立体的三维图形,从多个角度和空间对数据进行360°的静态以及动态默契。
多种图形类型
FlowJoTM除了提供传统的散点图,还提供多种图形类型(如密度图,等高图,伪色图,斑马图等),在满足不同分析需求的同期还保证了图像的好意思不雅和科学严谨需求。
多种设门器具
设门是流失数据分析中界定细胞目标群的必要妙技,岂论要检测的目标细胞群是要领漫步如故不要领漫步,小概率事件如故豪爽率事件,FlowJoTM提供了多种设门器具,从而让用户通俗的界定多样细胞群。
广宽的批量处理功能
用户不错作念一个样品的门分析,色狼窝然后将这个分析批处理当用到其他样品上;也不错作念一个样品的图形分析,然后将这个分析批处理用到其他样品上。这么幸免了对每一个样品进行同样性西宾的分析,即保证了数据分析的一致性及纯真性,同期也极地面提高了分析的扫尾何况赢得完整的分析扫尾。
门的批处理 你不错将一个样品的门分析,批量应用到其他的样品上。通盘历程只需要轻轻拖动鼠标就可完成,尽头圣洁。 图形分析的批处理 图像处理也不错用批量分析的表率,将一个样品的分析应用到其他样品上。多种分析平台及器具
FlowJo本人包含了多个极度的分析平台来满足细胞周期,细胞增殖,能源学(钙离子流量)等的分析。这些平台禁受泰斗的已发表的模子算法旨趣野心,来精准模拟数据漫步。FlowJoTM还包含了多种特有的分析器具,如数据合并、繁衍参数轴、校准、Backgating、Show Ancestry、Sample Comparision等,让你对数据作进一步的深层分析及处理。
荧光抵偿
荧光抵偿是六十分析内部一个紧要的想法亦然一个复杂的历程,却是流式分析必不行缺的部分。软件抵偿一自新去在机器上手动休养抵偿的冗长复杂历程,大大简化了荧光抵偿历程,将抵偿数据的历程形成一个可贯串,可见的圣洁历程,同期提供了在机器上手动抵偿所莫得的精准度和纯真性。
纯真通俗的数据导出
yqk 勾引数据的导出在FlowJo内部尽头的粗拙通俗。岂论是图形数据如故数据表格,都不错通俗的导出成多神志样用来作念数据的共享和发表。
软件特质
省时,批量分析样本; 分析和自动适度; 制作信息电影 研究分子相互作用,可视化化合物优先次第和化合物结构变嫌 基于结构的药物野心中,同期磋议多参数的分子结构 变嫌的收着力远高于只磋议亲和性的结构 能将已有的联系参数与及时3D可视化图形相结合10.8.1版新功能
添加了对大于 3 GB 的 FCS 文献的扶持 改进了对 MQD 文献的扶持 改进了对非 BD 细胞仪采集数据的扶持。 改进了内置 tSNE 以产生更好的优化图,处理了 10.7.2 中引入的问题。咱们依然改进了一个优化问题,以便输坐蓐生更好界说的岛屿。 改进了对 Jo 文献批量更始的扶持10.8版新功能
提高了大型责任区的计较速率 光谱抵偿矩阵归一化与 BD FACSDivaTM软件中的光谱抵偿一致 增多了奏凯开放 .jo 文献的功能 改进了 FlowJo 家数登录更新
改进的计较速率:
上图败露了多样责任区的再行计较时刻一个色导航,这些责任区在样本数目、样本大小和分析复杂性方面各不疏导。 咱们不错从这个图中得出论断,v10.8 将为大多数数据集提供状貌上的性能培育,但是关于更大的数据集,这种培育变得越来越权贵,尤其是那些由大宗小文献和很多门构成的数据集。
光谱抵偿:此时 FlowJo 已将系数抵偿矩阵正态化为“对角线”,即主检测器中的值。关于传统的抵偿表率,这将永远是最大值,扫尾对角线将是给定荧光染料信号的 100%。在光谱抵偿中,检测器数目和汇集参数之间不再存在 1:1 的关系,最大的荧光值可能不在主检测器中。 FlowJo 不时圭臬化到“主要”检测器并允许更大的数字。 BD FACSDivaTM 中的光谱抵偿反而正态化为最大值。紧要的是,这两种表率都莫得错。荧光值是相对的,系数测量值都将保执相对疏导,因此无需再行分析光谱抵偿数据。但是,当咱们发愤在咱们适度的系数软件之间更好地对皆时,咱们聘用对皆两种抵偿表率并正态化为最大的数字。这将允许 BD FACSDivaTM 和 FlowJo 用户之间更好的互操作性。
Jo 文献读取:FlowJo 9.x 版生成 .jo 类型文献行动分析输出。 10.8 版将是 10 版的最好版块,不错奏凯开放 .jo 文献并将其更始为 .wsp 文献。 对 XML 读取进行了一些调整,以更好地更始构成员身份、对皆时刻参数读取以及处理多个同名文献。
改进的 FlowJo 家数登录:当今许可证首选项中有一个‘Show Remember Me’复选框。 选中后,将败露一个复选框,允许用户让 FlowJo 记取他们用于登录的 FlowJo 家数字据 24 小时。 此外,默许情况下会选顶用于身份考证的 HTTPS。
造作成立:
荫藏抵偿矩阵中的行不再导致裁剪偏移问题。 在样本中拖动的布尔门不再参考原始总体。 将偏移直方图叠加导出为 pdf 不再将直方图推离图形 祖宗图当今打印为 PDF 将门复制到组不再闪避修改后的卑劣门。 系统需求 macOS最小成立
推选成立
8 GB 内存 Core II Duo 处理器或更好 MacOS 10.11 Sierra 或更新版块 用于离线序列号的汇集适配器 汇集适配器和站点许可证序列号的 Internet 伙同 16 GB 内存 Intel i7 四核处理器 Windows最小成立
推选成立
8 GB 内存 x86 或 x64 双核处理器 Windows Vista 用于离线序列号的汇集适配器 汇集适配器和站点许可证序列号的 Internet 伙同。 16 GB 内存 Intel i7 四核处理器 Windows 10一个色导航
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